菌物学报

2019, v.38;No.198(12) 2144-2160

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比较分析草菇与其他真菌直系同源基因的关系
Genome-wide analysis of the orthologous genes between Volvariella volvacea and other selected fungi

陶永新;车金超;宋寒冰;李自燕;段静怡;Irum Mukhtar;谢宝贵;

摘要(Abstract):

担子菌类的食用菌种类多、价值高、产量大,然而其产业的升级发展需要对食用菌生长发育相关生物学问题进行深入解析。目前多种食用菌完成了全基因组测序,然而作为非模式种其与模式丝状真菌间的直系同源基因目前尚缺乏全基因组水平的系统研究,在一定程度上限制了其分子生物学研究的深入。本研究以草菇为参照物种,将其与几种食用菌和模式丝状真菌进行两两直系同源基因分析,并对多物种间不同类型的直系同源基因进行功能富集。结果显示:一对一直系同源基因较多富集于基因复制、转录、翻译、修饰、加工等保守的基本功能类别;非一对一直系同源基因多属于基因家族,且包含了65%的转录因子,功能上富集在碳水化合物、脂质、氨基酸、次生代谢物及外源物质的代谢通路。无直系同源基因则较多富集在与基因重组、修复、信号转导相关的功能类别、特导性转录因子以及未知的预测基因。结果为食用菌分子生物学的深入研究提供有价值的参考。

关键词(KeyWords): 食用真菌;丝状真菌;基因组;直系同源基因

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 福建省自然科学基金(2019J01380);; 福建农林大学园艺学院青年学术骨干培养基金(61201400706);福建农林大学科技创新专项基金(CXZX2017184);; 国家重点基础研究发展计划项目“食用菌产量和品质形成的分子机理及调控”(2014CB138302);; 木生型食用菌品种选育与产业化工程项目(fjzycxny2017010);; 福建省食用菌产业体系站长(K83139296);; 国家自然科学基金(31801920)~~

作者(Author): 陶永新;车金超;宋寒冰;李自燕;段静怡;Irum Mukhtar;谢宝贵;

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DOI: 10.13346/j.mycosystema.190263

参考文献(References):

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