菌物学报

2020, v.39;No.206(08) 1510-1519

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黑木耳实时荧光定量PCR内参基因的筛选
Screening of reference genes for qRT-PCR amplification in Auricularia heimuer

张越;姚方杰;孙文娟;方明;武春爽;

摘要(Abstract):

黑木耳Auricularia heimuer是我国主要栽培的食用菌之一,具有较高的经济价值和生态价值。本研究以黑木耳不同菌株(A14、A137和A12)和不同生育期的样品(菌丝体、原基和子实体)为实验材料,提取RNA,反转录成cDNA,在全基因组注释结果的基础上,选择12个候选内参基因(APRTase、β-TUB、RPL2、EF-1a、EF-2、PGI、PGM、H~+-ATPase、Tspd、TUB-1a、18S rRNA和28S rRNA)并设计跨内含子的引物,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术进行扩增,利用geNorm、NormFinder、BestKeeper和ΔCt算法以及综合评价软件RefFinder,筛选适宜的内参基因。结果表明18S rRNA、β-TUB、EF1-a和28S rRNA适宜作为不同菌株的内参基因,APRTase、18S rRNA和28S rRNA适宜作为不同生育期的内参基因。

关键词(KeyWords): 候选内参基因;核糖核酸;互补DNA;不同菌株;不同生育期

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 现代农业产业技术体系专项资金(CARS20)~~

作者(Author): 张越;姚方杰;孙文娟;方明;武春爽;

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参考文献(References):

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